10月19日，2021全国大众创业万众创新活动周深圳活动暨第七届深圳国际创客周在河套深港科技创新合作区隆重举办。10月19日，2021全國大眾創業萬眾創新活動周深圳活動暨第七屆深圳國際創客周在河套深港科技創新合作區隆重舉辦。
      10月25日，深圳國資國企產業創新中心和深圳國資國企改革創新研究院啟用活動隆重舉行。首批11個項目與深港科創公司完成簽約。
      10月26日，黃敏常務副市長在深港聯合辦公室（廣田深港科技園）主持召開市領導小組辦公室第十四次會議。

9月6日，深投控副總經理兼深港科創公司董事長與香港科技園公司行政總裁共同簽署《發展「香港科學園深圳分園」框架協議》，廣東省委副書記、深圳市委書記王偉中，香港特別行政區行政長官林鄭月娥等領導見證簽約儀式。

7月1日，組織收看慶祝中國共產黨成立100周年大會直播，聆聽習近平總書記在中國共產黨成立100周年大會上的重要講話。

公司榮獲「深圳市五一勞動獎狀」。

河套深港科技創新合作區「e站通」綜合服務中心啟動儀式成功舉辦。

《河套深港科技創新合作區深圳園區投融資方案》經市政府常務會議審議通過。

8月14日，皇崗口岸片區城市設計國際競賽正式定標，世界設計機構 Zaha·Hadid（紮哈·哈迪德）建築事務所中標。

8月28日，深港科創綜合服務中心全過程設計國際競賽定標，中標單位為Rogers 羅傑斯事務所（英國）與 CCDI 中建國際（中國）公司。

8月31日，河套區港深創新及科技園發展聯合專責小組第七次會議以視訊會議形式舉行，會議由艾學峰副市長和香港創新及科技局薛永恆局長共同主持，市投資控股有限公司副總經理兼深港科創公司董事長王昱文出席了會議。

7月16至17日，深港科技創新合作區深圳園區皇崗口岸片區城市設計國際競賽方案評審會成功舉辦，全球15家知名設計機構（聯合體）公開展示與陳述設計方案。市委常委、常務副市長劉慶生出席活動並致辭。經專家評選，前3名優勝方案單位分別為：Tekuma Frenchman Urban Design, LLC +深圳市局內設計諮詢有限公司+深圳市綜合交通設計研究院有限公司；MVRDV B.V.+上海同濟城市規劃設計研究院有限 公司+同濟大學建築設計研究院（集團）有限公司；Zaha Hadid Limited(紮哈·哈迪德建築事務所)。

3月19日，深港科技創新合作區深圳園區皇崗口岸片區城市設計國際競賽定向邀請單位資格評審會在長合作區展示交流中心召開，與會專家從受邀機構中評選出5家入圍單位，分別為：紮哈哈迪德建築事務所（英國，普里茲克獎）、大都會建築事務所（荷蘭，普里茲克獎）、墨菲西斯建築師事務所（美國，普里茲克獎）、格雷姆肖建築事務所（英國，高技派)、馬岩松建築事務所聯合體（中國，先鋒事務所代表）。

11月22日，合作區深圳園區項目集中開工儀式成功舉行。省委副書記、市委書記王偉中宣佈開工，市委副書記、市長陳如桂到會致辭，市委常委、常務副市長劉慶生主持儀式。

8月9日，中共中央、國務院印發《關於支援深圳建設中國特色社會主義先行示範區的意見》，明確“加快深港科技創新合作區建設，探索協同開發模式，創新科技管理機制，促進人員、資金、技術和資訊等要素高效便捷流動。”深港科技創新合作區成為粵港澳大灣區和先行示範區建設的重大平臺和重要載體。

8月27日，深港開放創新中心建築設計國際競賽舉行方案評審會，7位專家從入圍作品中評選出2個優勝方案。

8月28日，公司舉辦首屆深港科創論壇，超過180人參加論壇。

6月30日，公司組織召開《合作區深圳園區統籌規劃實施方案》專家評審會，7位境內外知名規劃專家對編制成果高度認可並一致同意通過評審。

4月18日，市委副書記、市長陳如桂赴合作區深圳園區調研並主持召開綜合性國家科學中心建設協調會，公司專題彙報合作區深圳園區集中啟動區首批開發專案情況。

2月13日，省委副書記、市委書記王偉中主持召開市建設深港科技創新合作區領導小組第三次會議，會議明確公司定位為合作區深圳園區規劃設計、開發建設、資源導入和運營管理執行主體。

2月18日，中共中央、國務院印發《粵港澳大灣區發展規劃綱要》，明確“支持落馬洲河套港深創新及科技園和毗鄰的深方科創園區建設，共同打造科技創新合作區，建立有利於科技產業創新的國際化營商環境，實現創新要素便捷有效流動。”合作區作為《規劃綱要》中唯一定位以科技創新為主題的合作區，上升為國家戰略。

11月9日，公司召開股東會2018年度第一次會議暨成立大會，會議審議通過《公司章程》，市投資控股公司、深業集團和福田投控公司分別持股65%、25%和10%，同意王昱文任法定代表人、董事長兼總經理。同日，完成公司工商註冊並取得營業執照。

7月9日，省委常委、市委書記王偉中主持召開市建設深港科技創新合作區領導小組第一次會議，會議原則同意深圳深港科技創新合作區發展有限公司組建方案。

4月8日，市委常委、常務副市長劉慶生主持召開市建設深港科技創新合作區領導小組辦公室第一次會議，會議要求市國資委組建合作區深圳園區開發運營管理公司。市國資委於4月28日正式上報組建方案，由市投資控股公司牽頭成立深圳深港科技創新合作區發展有限公司。

3月6日，省委常委、市委書記王偉中主持召開落馬洲河套片區規劃建設專題會議，會議明確提出“組建合作區深圳園區開發運營管理公司，由具備雄厚實力和綜合開發經驗、熟悉香港和內地運作的市屬國企具體承擔”。

12月18日，公司“十四五”發展規劃通過專家評審。

12月30日，河套合作區東翼首批項目-1順利開工。

10月8日，公司正式取得“e站通”綜合服務中心運營權。

10月14日，深圳經濟特區建立40周年慶祝大會在深圳市隆重舉行。中共中央總書記、國家主席、中央軍委主席習近平出席大會並發表重要講話，強調要“規劃建設好河套深港科技創新合作區”。

10月18日，第二屆深港科創論壇在會展中心會議廳成功舉辦。本屆論壇主題為“聚焦生命科學‧暢想未來創新”，邀請了諾貝爾生理學或醫學獎得主厄溫‧內爾教授等知名專家出席活動。

9月14日，市委常委、常務副市長劉慶生同誌在市民中心主持召開合作區深圳園區投融資方案專題會，原則通過了《深港科技創新合作區深圳園區投融資方案》。